手术衣在手术过程中起双向防护作用。首先，手术衣在患者与医务人员之间建立一道屏障，手术过程中降低医务人员接触患者血液或其他体液等潜在感染源的概率；其次，手术衣可以阻断定植／黏附在医务人员皮肤或衣服表面的各种细菌传播给手术患者，有效避免多重耐药菌如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）、耐万古霉素肠球菌（VRE）等的交叉感染。因此，手术衣的屏障功能被视为手术过程中降低感染风险的关键